Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timm44O35857 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm44O35857 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm44O35857 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm44O35857 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm44O35857 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm44O35857 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm44O35857 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Timm44O35857 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms