Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf12O35738 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf12O35738 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms