Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag2O35638 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stag2O35638 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stag2O35638 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stag2O35638 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms