Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sema6aO35464 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sema6aO35464 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms