Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TnxbO35452 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnxbO35452 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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TnxbO35452 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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TnxbO35452 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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TnxbO35452 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TnxbO35452 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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TnxbO35452 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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TnxbO35452 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TnxbO35452 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TnxbO35452 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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TnxbO35452 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TnxbO35452 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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