Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt1O35449 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrt1O35449 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms