Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kpna6O35345 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kpna6O35345 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna6O35345 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna6O35345 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna6O35345 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna6O35345 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna6O35345 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna6O35345 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna6O35345 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna6O35345 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kpna6O35345 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna6O35345 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna6O35345 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna6O35345 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna6O35345 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna6O35345 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna6O35345 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms