Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CenpaO35216 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CenpaO35216 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms