Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Eftud2O08810 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Eftud2O08810 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms