Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CckarO08786 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CckarO08786 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CckarO08786 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckarO08786 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckarO08786 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckarO08786 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckarO08786 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckarO08786 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckarO08786 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CckarO08786 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CckarO08786 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CckarO08786 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CckarO08786 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckarO08786 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckarO08786 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckarO08786 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckarO08786 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckarO08786 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckarO08786 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckarO08786 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CckarO08786 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckarO08786 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckarO08786 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CckarO08786 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckarO08786 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckarO08786 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckarO08786 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckarO08786 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckarO08786 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CckarO08786 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckarO08786 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CckarO08786 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CckarO08786 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CckarO08786 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CckarO08786 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckarO08786 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckarO08786 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms