Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Barx2O08686 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Barx2O08686 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Barx2O08686 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Barx2O08686 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Barx2O08686 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms