Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MttpO08601 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MttpO08601 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MttpO08601 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MttpO08601 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MttpO08601 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MttpO08601 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MttpO08601 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MttpO08601 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MttpO08601 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MttpO08601 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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MttpO08601 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MttpO08601 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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MttpO08601 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MttpO08601 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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MttpO08601 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MttpO08601 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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MttpO08601 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MttpO08601 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MttpO08601 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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MttpO08601 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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MttpO08601 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MttpO08601 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MttpO08601 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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MttpO08601 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MttpO08601 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MttpO08601 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MttpO08601 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MttpO08601 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MttpO08601 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MttpO08601 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MttpO08601 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MttpO08601 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MttpO08601 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MttpO08601 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MttpO08601 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MttpO08601 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MttpO08601 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MttpO08601 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MttpO08601 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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