Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efna5O08543 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efna5O08543 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efna5O08543 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efna5O08543 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Efna5O08543 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efna5O08543 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efna5O08543 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efna5O08543 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efna5O08543 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Efna5O08543 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efna5O08543 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Efna5O08543 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna5O08543 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna5O08543 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna5O08543 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Efna5O08543 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Efna5O08543 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Efna5O08543 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Efna5O08543 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna5O08543 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna5O08543 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna5O08543 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efna5O08543 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Efna5O08543 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Efna5O08543 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Efna5O08543 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efna5O08543 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efna5O08543 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Efna5O08543 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efna5O08543 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efna5O08543 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efna5O08543 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna5O08543 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efna5O08543 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms