Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm21887J3QQ04 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms