Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm9602J3QPD5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm9602J3QPD5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms