Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smim18J3QNP2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smim18J3QNP2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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