Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AK157302I3ITR1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AK157302I3ITR1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AK157302I3ITR1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms