Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20696H3BJN7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20696H3BJN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.2 ms