Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip12G5E870 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trip12G5E870 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip12G5E870 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip12G5E870 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms