Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp2b1G5E829 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atp2b1G5E829 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b1G5E829 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b1G5E829 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b1G5E829 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b1G5E829 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atp2b1G5E829 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atp2b1G5E829 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms