Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r58G3X9U3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vmn1r58G3X9U3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms