Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim55G3X8Y1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim55G3X8Y1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms