Protein–RNA interactions for Protein: G3X8U2

1700067P10Rik, RIKEN cDNA 1700067P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700067P10RikG3X8U2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700067P10RikG3X8U2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700067P10RikG3X8U2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms