Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmigd3G3X8R9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmigd3G3X8R9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmigd3G3X8R9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms