Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx1-1G3UXB3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-1G3UXB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-1G3UXB3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms