Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
5830473C10RikF8VQ07 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
5830473C10RikF8VQ07 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5830473C10RikF8VQ07 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms