Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ercc6F8VPZ5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ercc6F8VPZ5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ercc6F8VPZ5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ercc6F8VPZ5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms