Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm28048F7BCN0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm28048F7BCN0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms