Protein–RNA interactions for Protein: F6ZR08

Gm15056, Predicted gene 15056, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15056F6ZR08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm15056F6ZR08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm15056F6ZR08 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms