Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
D430041D05RikF6ZGR6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
D430041D05RikF6ZGR6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
D430041D05RikF6ZGR6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms