Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Crocc2F6XLV1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Crocc2F6XLV1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Crocc2F6XLV1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Crocc2F6XLV1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms