Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pagr1bF6V0H0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pagr1bF6V0H0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pagr1bF6V0H0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms