Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933403O08RikF6UK53 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933403O08RikF6UK53 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms