Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prss56F2YMG0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Prss56F2YMG0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms