Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrdnE9Q9K5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrdnE9Q9K5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms