Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp31E9Q6Y8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp31E9Q6Y8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp31E9Q6Y8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms