Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Srsf11E9Q6E5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Srsf11E9Q6E5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms