Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PtproE9Q612 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtproE9Q612 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms