Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DspE9Q557 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DspE9Q557 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DspE9Q557 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DspE9Q557 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DspE9Q557 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms