Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17727E9Q4V7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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