Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde8bE9Q4S1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde8bE9Q4S1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde8bE9Q4S1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms