Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ApobE9Q414 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ApobE9Q414 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206 ms