Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm3250E9Q1M3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3250E9Q1M3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm3250E9Q1M3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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