Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Myo5cE9Q1F5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Myo5cE9Q1F5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Myo5cE9Q1F5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Myo5cE9Q1F5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms