Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
2610021A01RikE9Q0Q3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
2610021A01RikE9Q0Q3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms