Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ryr1E9PZQ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ryr1E9PZQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ryr1E9PZQ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms