Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ19

Igsf9b, Protein turtle homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9bE9PZ19 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igsf9bE9PZ19 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igsf9bE9PZ19 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms