Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc175E9PVB3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc175E9PVB3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms