Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Syde2E9PUP1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syde2E9PUP1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syde2E9PUP1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms