Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
4930558K02RikE0CXC6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4930558K02RikE0CXC6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms